Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54bQ6PFE3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms