Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Dtx4Q6PDK8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms