Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zbtb40Q6PCS8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbtb40Q6PCS8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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