Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rexo4Q6PAQ4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rexo4Q6PAQ4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms