Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc148Q6P5U8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms