Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg2aQ6P4T0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atg2aQ6P4T0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms