Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nsd3Q6P2L6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nsd3Q6P2L6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms