Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4Q6P1D7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slx4Q6P1D7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slx4Q6P1D7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms