Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdcd11Q6NS46 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms