Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cep78Q6IRU7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cep78Q6IRU7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms