Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt39Q6IFX4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt39Q6IFX4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms