Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt42Q6IFX2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms