Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arhgap20Q6IFT4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms