Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms