Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg9bQ6EBV9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Atg9bQ6EBV9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg9bQ6EBV9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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