Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lemd2Q6DVA0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lemd2Q6DVA0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms