Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Smarca2Q6DIC0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Smarca2Q6DIC0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms