Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rftn1Q6A0D4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms