Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nlrp4eQ66X19 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nlrp4eQ66X19 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms