Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q66JV7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q66JV7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q66JV7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q66JV7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms