Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Knl1Q66JQ7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Knl1Q66JQ7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms