Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VclQ64727 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VclQ64727 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VclQ64727 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VclQ64727 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VclQ64727 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VclQ64727 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VclQ64727 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VclQ64727 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VclQ64727 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms