Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gdpd5Q640M6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gdpd5Q640M6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gdpd5Q640M6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gdpd5Q640M6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gdpd5Q640M6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd5Q640M6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms