Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a5Q63ZW6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a5Q63ZW6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms