Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vamp1Q62442 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vamp1Q62442 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms