Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sh3gl2Q62420 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms