Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AtmQ62388 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AtmQ62388 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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