Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sycp1Q62209 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sycp1Q62209 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms