Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npm1Q61937 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npm1Q61937 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Npm1Q61937 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms