Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prg2Q61878 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prg2Q61878 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Prg2Q61878 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg2Q61878 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms