Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gli3Q61602 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gli3Q61602 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gli3Q61602 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gli3Q61602 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gli3Q61602 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gli3Q61602 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms