Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcd1Q61466 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smarcd1Q61466 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms