Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms