Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cnot7Q60809 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnot7Q60809 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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