Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atf3Q60765 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atf3Q60765 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms