Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Foxd4Q60688 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxd4Q60688 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms