Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prdm1Q60636 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms