Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd5Q5VCS6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd5Q5VCS6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms