Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Utp18Q5SSI6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Utp18Q5SSI6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms