Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf12Q5SPL2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms