Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc44a5Q5RJI2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Slc44a5Q5RJI2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms