Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim41Q5NCC3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim41Q5NCC3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms