Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps41Q5KU39 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms