Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnni3kQ5GIG6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnni3kQ5GIG6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms