Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usp22Q5DU02 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp22Q5DU02 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms