Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms