Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrfip1Q3UZ39 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms