Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc160Q3UYG1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc160Q3UYG1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms