Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim40Q3UWA4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim40Q3UWA4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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