Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms